Cap de les soques víriques del laboratori coincideix amb la soca del brot. El virus detectat en porcs senglars presenta una empremta genètica pròpia, amb mutacions i una gran deleció que el situen com una variant nova o no documentada fins ara
L’estudi ha analitzat les 17 soques del virus de la PPA amb què s’ha treballat recentment a cap laboratori situat dins del radi del focus. Els resultats són concloents: cap d’aquestes soques coincideix genèticament amb la soca responsable del brot actual.
Les diferències observades són massa importants per establir cap relació directa. El virus detectat a Cerdanyola del Vallès presenta desenes de mutacions específiques i una gran deleció genòmica que no apareixen en cap de les soques del laboratori analitzades.
Aquest conjunt de diferències no permeten confirmar que el brot tingui l’origen en aquestes mostres. Els laboratoris de referència del Ministeri i d’Europa hauran de confirmar els resultats.
Una variant genètica nova o no documentada fins ara
La seqüenciació completa del genoma del virus del brot indica que es tracta d’una soca de PPA de genotip II, amb trets generals semblants al virus detectat anteriorment, però amb canvis genètics substancials no descrits prèviament.
Aquesta “empremta genètica” singular inclou:
- Una gran pèrdua d’un fragment del genoma (deleció).
- Un conjunt de mutacions exclusives que no coincideixen amb les soques habituals que circulen actualment a Europa occidental.
Aquest patró genètic mostra més similituds amb alguns casos aïllats descrits en països de l’Europa de l’Est i d’Àsia, com Rússia, la Xina o Tailàndia, i indica que ens trobem davant d’una variant nova o no documentada fins ara.
Resultats en la línia de l’informe del Comitè auditor
Tot i que encara es disposa d’altres soques històriques que encara s’estan seqüenciant a l’IRB, aquestes no han estat utilitzades recentment i presenten característiques genètiques molt més similars a virus detectats anteriorment que no pas a la del brot actual.
Per tant, els resultats estan alineats amb l’informe del Comitè auditor, que assenyalava que no s’havia detectat cap incidència en les mesures de biocontenció dels laboratoris, que pugui justificar la sospita d’una fuita accidental.
Context de la detecció i importància de la seqüenciació
El brot va ser detectat en una fase inicial gràcies als programes de vigilància sanitària continuada del porcí i de la fauna salvatge que l’IRTA-CReSA desenvolupa a Catalunya des de l’any 2018. Tots els porcs senglars trobats morts són sistemàticament analitzats per descartar la presència del virus de la PPA, encara que no hi hagi sospita prèvia.
La seqüenciació genòmica completa és una eina clau perquè permet obtenir una autèntica “empremta digital” del virus, comparar-lo amb altres soques víriques conegudes i descartar o confirmar possibles vies d’origen amb un alt grau de fiabilitat científica.
Hipòtesis sobre l’origen del brot
La pesta porcina africana no es transmet per l’aire i requereix contacte directe o exposició continuada a material contaminat. En coherència amb l’experiència internacional, la hipòtesi més plausible és la introducció del virus a través de material contaminat, especialment aliments d’origen porcí, una via que ja s’ha identificat com a probable en brots detectats anteriorment en altres països europeus.
El Govern, coordinat per a la contenció del brot
El Govern continua treballant amb l’objectiu de contenir el brot de pesta porcina africana en els 6 kilòmetres del radi, amb més de 400 efectius desplegats sobre el terreny, entre el Grup d’Ordre, el Cos d’Agents Rurals i la UME.
Fins avui, s’han analitzat 533 porcs senglars, dels quals 29 són positius dins del radi dels 6 kilòmetres, confirmats pel laboratori de referència del Ministeri.
El Govern continua mantenint puntualment reunions amb el sector i amb el grup d’experts, així com amb els alcaldes dels municipis de dins del radi, amb l’objectiu de treballar coordinats per mantenir controlat el focus.
El Govern ha traslladat avui al Ministeri d’Agricultura els resultats de l’anàlisi genòmica completa del virus de la pesta porcina africana (PPA) detectat recentment en porcs senglars a Cerdanyola del Vallès. L’estudi de seqüenciació, liderat pel professor d’investigació ICREA expert reconegut en filogènia i genòmica comparativa.Toni Gabaldón a l’Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona), ha estat desenvolupat pel seu grup de Genòmica Comparativa.
